序一序二序三卷上十二经总括诊三部脉法三部九候左右三部六候四季脉名诊五脏四季常脉定四季六脏平脉定四季相克脉诊五脏贼邪脉诊四时虚实脉歌下指轻重法诊五脏动脉法诊六腑平脉法脉息大数诊五脏脉诀男女反脉观人形性脉
序自序上集伤寒正名论王叔和辟泥四时论病之谬辟泥日数分经之谬论陶节庵论吴又可诸家编次司天运气分别阴阳十二经离合察脉大法寸口脉论趺阳少阴脉论脉分阴阳死生论仲景六经辨证与内经热病论互异辨中风一辨中风二辨中风
首序自序性命篇上性命篇下补遗篇一补遗篇二辟邪篇太极图说注解序周子太极图（缺）无极而太极后跋
金匮玉函要略方论序金匮要略序（出赵本．）金匮玉函要略综概卷一脏腑经络先后病脉证第一（论十三首、脉证三条）湿病脉证第二（论一首、脉证十二条、方十一首）百合狐惑阴阳毒病证治第三（论一首、证三条、方十二首）
卷上第一问 精血以分男女之本源第二问 古法男子三十而娶女子二十而嫁第三问 妇人感病倍于男子第四问 何以谓之天癸第五问 何以谓之经候第六问 经候或前或后多寡不定第七问 月水根据时来不快利第八问 经水欲行
简介序卷一卷二卷三卷四
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
吴序尤序薛序卷上卷下纳音释义静观居士云游疏
自序卷之一痈疽之源（一）痈疽之别（二）脉法（三）分经络（四）善恶（五）虚实（六）内消（七）内托（八）灸（九）针烙（十）砭镰（十一）敷贴(十二）淋洗（十三）将护（十四）禁忌（十五）肿疡(十六)发表辛凉解
原序上卷桂枝汤证桂枝汤证其一桂枝汤证其二桂枝汤证其三桂枝汤证其四（附列门人治验）桂枝汤证其五（附列门人治验）桂枝汤证其六（附列门人治验）麻黄汤证麻黄汤证其一麻黄汤证其二麻黄汤证其三麻黄汤证其四葛根汤证