序自序卷一卷二卷三卷四
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
金匮要略论注
素问上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合论篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九五藏生成篇第十五藏别论篇第十一异法方宜论篇第十二移
曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分第6部分第7部分
序一序二自叙天癸确论调经经水先期第一经水先期第二经水先期第三经水先期第四经水再至第五经水再至第六经水后期第一经水后期第二经水后期第三经水后期第四经水两月一至第五经水两月一至第六经水或先或后忽多忽少或来
序序例第一案~第九案第十案~第十九案第二十案~第二十九案第三十案~第三十九案第四十案~第四十九案后记
卷上一、元气亏损内伤外感等症二、饮食劳倦亏损元气等症三、脾胃亏损心腹作痛等症四、脾肾虚寒阳气脱陷等症五、命门火衰不能生土等症六、肾虚火不归经发热等症七、脾胃亏损吞酸嗳腐等症八、脾肾亏损停食泄泻等症九、
叙万氏幼科源流序卷之一形气发微论原病论入门审候歌观面部五脏形歌观面部五色歌三关脉纹变见歌小儿正诀指南赋胎疾脐风变蒸变蒸兼证幼疾五脏诸证肝经主病肝经兼证肝所生病急慢惊风急惊风有三因卷之二急惊风证急惊风变