内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
简介自序凡例补养之剂第一发表之剂第二涌吐之剂第三攻里之剂第四表里之剂第五和解之剂第六理气之剂第七理血之剂第八祛风之剂第九祛寒之剂第十清暑之剂第十一利湿之剂第十二润燥之剂第十三泻火之剂第十四除痰之剂第十
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
重订诊家直诀
原序钱仲阳传卷上 脉证治法小儿脉法变蒸五脏所主五脏病肝外感生风肝热肺热肺盛复有风冷肺虚热肺脏怯心热心实肾虚面上证目内证肝病胜肺肺病胜肝肝有风肝有热肝有风甚惊痫发搐早晨发搐日午发搐日晚发搐夜间发搐伤风后
内外伤寒辩惑论
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
自序白苔舌总论黄苔舌总论黑苔舌总论灰色舌总论红色舌总论紫色舌总论霉酱色苔舌总论蓝色苔舌总论妊娠伤寒舌总论
自叙凡例白喉证论辩证法辨脉法用药法白喉热证尚轻治法白喉热证渐重治法白喉寒证尚轻治法白喉寒证渐重治法白喉虚热证治法白喉虚寒证治法白喉寒热错杂证治法续方白喉误治坏证治法白喉愈后补虚治法妇人白喉证小儿白喉证
卷上四时正脉春夏秋冬中真脉厥阴所胜生病运气所胜司天所胜在泉所胜少阴所胜生病运胜天胜地胜太阴所胜生病运胜天胜地胜阳明所胜生病运胜天胜地胜太阳所胜生病运胜天胜地胜少阳所胜生病天胜地胜六气复而生病厥阴之复少